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RNA纯化常见问题和解决方案(上)

886 人阅读发布时间:2010-09-17 11:03

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Western Blot标准实验步骤

成功进行WB检测,则设置合适正确的对照是必不可少的,只要正确设置了这些对照,即可快速和准确的找到WB的问题所在,并保证实验结果的准确性和特异性!一般需要设置的对照如下:

  • 阳性对照:明确表达检测蛋白的组织或细胞,用于检测抗体的工作效率
  • 阴性对照:明确不表达检测蛋白组织或细胞,用于检测抗体的特异性
  • 二抗对照:不加一抗,用于检测二抗的特异性
  • 内参对照:检测标本的质量和二抗系统
  • 空白对照:不加一抗和二抗;用于检测膜的性质和封闭的效果

WB检测基本过程

1提取抗原蛋白
将提取RNA途中留存的样品,加入150μl100%酒精充分混匀,静置5min(RT),2000×g,4离心5min,吸取上清至新管中,加入750μl异丙醇,混匀,静置10min(RT),12000×g,4离心10min,弃上清,加入1ml0.3mol/L盐酸胍/95%酒精重悬沉淀,用加样器打散沉淀,混旋20~30,静置20min(RT),7500×g,4离心5min,弃上清,重新加入1ml0.3mol/L盐酸胍/95%酒精两次,重悬沉淀,离心后弃上清,加入100%无水乙醇1ml,混旋1min,静置20min(RT),7500×g,4离心5min,弃上清,真空干燥5min,50μl1%SDS溶解沉淀,用50热水助溶,直至全部溶解。10000×g,离心10min,去除沉渣。

注意选择合适的蛋白酶抑制剂,避免蛋白降解,从而保证检测的准确性!

2、蛋白定量

常用的蛋白定量方法:Bradford assay, Lowry assay BCA assay。定量后,可根据情况将标本保存在-20°C /-80°C备用,进行免疫沉淀(IP)或者直接进行电泳分离蛋白

3、电泳分离蛋白质

1.makegel

  11%分离胶 12ml 两块胶         

4%积层胶6ml两块胶

  DW            4.36 ml   

        DW        堵漏     3.66ml

 3M  Tris        3.0 ml

        0.5M  Tris           1.5 ml

  30%Arc         4.4 ml

        30%Arc    0.5 ml     0.78 ml

  10%SDS        0.24 ml

        10%SDS              60 ul

  10%APS        0.12 ml

        10%APS    20ul      30 ul

  TEMED         10ul

        TEMED     5ul       6ul

2.上样前样品处理:
样品1003分钟、冷却,900×g、离心30S
3
.通电电:积层胶电泳电压50V左右,分离胶电泳电压90110V
4
.考马斯亮蓝染色:1小时,1号脱色1小时,2号脱色2小时。

4、转膜

根据不同的检测目的和待测蛋白的特性,选择合适的膜类型。常用的转移膜类型有:PVDF膜、硝酸纤维素膜(NC膜)和尼龙膜,其中PVDFNC膜的使用频率最高。各种膜的技术参数及比较如下:

 

PVDF

NC

尼龙膜

灵敏度和分辨率

背景

较高

蛋白结合能力

100-200ug/cm2(适用于SDS存在时与蛋白结合)

80-100ug/cm2

>400ug/cm2

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