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基因组DNA提取常见问题及解决方案

6365 人阅读发布时间:2010-09-20 10:03

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基因组DNA提取常见问题及解决方案

1 没有或获得的DNA量很少

A 确保DNA Wash Buffer中是否加入要求量的无水乙醇

B 样品裂解不充分

建议:加大裂解缓冲液的量或减少样品的量;将组织材料充分研磨或匀浆;需要蛋白酶K消化的样品,增加蛋白酶K的用量,或者延长蛋白酶K的消化时间,并将组织尽可能的减碎。

C 吸附不充分

建议:上柱前,请确保裂解混合液中加入适量的无水乙醇。

D DNA洗脱不当

建议:洗脱液较少时,应加在膜的中间;采用ddH2O洗脱时,应保证pH值在7.0-8.5;样品量较少时,若洗脱体积过大,会相应降低DNA的浓度

E 样品中DNA含量少

如果样品中本身DNA含量少,应加大初始材料的量,并相应的增加各种缓冲液的量。

2 柱子堵塞,或者膜上颜色残留

A 样品过多

建议:减少样品的使用量,或者增加裂解缓冲液的量

B 样品裂解不充分,使用了过多的样品,或者样品没有研磨充分

建议:减少样品的使用量,充分研磨样品或者增加裂解液用量

C 裂解后,吸取上清时,带入杂质

建议:离心后,小心吸取上清,避免吸起沉淀,如有沉淀吸起,再次离心后吸取上清。

3 OD260/OD280偏低

A 蛋白质残留

建议:离心后,吸取上清时,应尽量避免吸起沉淀

B ddH2O洗脱DNA时,因为pH和离子浓度的影响,OD比值可能会偏低,但是并不代表纯度低。

C OD260/OD280偏高

A RNA残留

建议:检查RNase A是否加入,或者RNase A活性下降。

5 不能顺利用于后续酶反应实验

A 乙醇残留

建议:在洗脱前,将吸附柱开盖再次离心,以彻底去除残留的乙醇。

 

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